В Minecraft Dungeons есть определённый тип врагов, чаще всего называемый Мини-Боссами (англ. Mini-boss). Их отличает повышенная сила, относительно редкое появление в игре, а также большой запас здоровья и повышенный урон. Это так же единственный тип мобов, которые появляются в локациях в зависимости от уровня сложности. Некоторые мини-боссы могли появляться как обычные боссы на разных локациях, но в версии 1.10.1.0. эту возможность убрали. Они сильнее обычных мобов, но слабее боссов.
Материковые[]
Мини-боссы, появляющиеся на Материке.
Странник Края — Тёмный и высокий моб. При стандартном уровне сложности появляется на уровнях: Мокрое болото, Пустынный храм, Тёмные джунгли, Заросший храм Искажённый лес, Крепость, Глухомань Края и Разрушенная цитадель. В отличии от странника Края из оригинальной игры не получает урон при контакте с водой, но при этом восприимчив к дальнобойным атакам. В Minecraft Dungeons Arcade является полноценным боссом в локации Мокрых болот.
Вызыватель — злодеянин в тёмной мантии. На стандартном уровне сложности появляется в Тыквенных пастибщах, Шахтах красного камня Залах высокоблочья, Обсидиановой вершине, и иногда в Коллосальных укреплениях и Ветренных пиках вместо Иллюзиониста. Имеет куда меньшую дальность атаки, чем Вызыватель из оригинальной игры (В оригинале 16 блоков, а в Dungeons 7). Так же призывает большее количество Досождателей (В оригинале 3, а в Dungeons 4). Появлялся как главный босс в Тыквенных пастбищах до версии 1.10.1.0, но после этой версии он перестал им быть. Однако, в Minecraft Dungeons Arcade он появляется как главный босс в Тыквенных пастбищах.
Голем Красного Камня — мощный, каменный голем из красного камня. Уменьшенная версия Чудовища Красного Камня. Является единственным полностью уникальным материковым мини-боссом. Появляется в Шахтах красного камня, Пылающей кузнице, Обсидианновой вершине и Крепости. До версии 1.10.1.0. был основным боссом Шахт красного камня. Имеет уникальную способность.
Скелеты-Всадники — скелет на лошади-скелете в зачарованном шлеме. Всегда появляется в количестве четырёх штук. Изредка появляются в Каньоне кактусов и в Тёмных джунглях. Являются аллюзией на библейских всадников апокалипсиса. Почти всегда появляются на локациях только на сложности "Приключение" или выше.
Мини-Боссы DLC[]
Мини-боссы, встречающиеся на уровнях DLC.
Иллюзионист - злодеянин в тёмно-фиолетовой мантии. Является обновлённой и доработанной версией Иллюзиониста из Minecraft: Java. Появляется на уровнях Обледеневший Фьорд, Одинокая Крепость, Забытое Поселение