В режиме Survival, существует 4-е сложности: Peaceful (мирный), Easy (лёгкий), Normal (нормальный), и Hard (трудный).
Peaceful Mode:
или мирный
У игрока автоматически восстанавливается здоровье, а голод не тратится. Вражеские мобы не спаунятся.
Easy Mode:
или лёгкий
Вражеские мобы спаунятся. Мобы наносят минимум урона. Криперы отменяют свой взрыв на короткой дистанции от игрока. Пещерный паук не может отравить игрока на этой сложности.
Normal Mode:
или нормальный
Вражеские мобы спаунятся. Мобы наносят стандартный урон и имеют стандартное здоровье.
Hard Mode:
или трудный
Вражеские мобы спаунятся. Мобы наносят гораздо больше урона, чем на Normal Mode. Криперы отменяют свой взрыв, только если между игроком и мобом очень большое расстояние. Это делает взрыв почти неизбежным. С версии 12w06a зомби на этом уровне сложности могут выламывать двери. Игрок может погибнуть от голода.
23 октября 2010 года в Твиттере Нотч заявил: "Я предпочитаю называть не "сложность", а "реализм", где наименьшее значение - творчество, а наибольшее - измор."