Здоровье — шкала жизни игрока в версиях Survival Test, Indev, Infdev, Alpha и Beta. Каждое сердце состоит из двух половинок, поэтому максимальное здоровье составляет 20 единиц.
Здоровье можно потерять упав с высоты, получив урон от враждебного моба, получив урон от выстрела из лука, находясь рядом с огнём или лавой, задыхаясь под водой, застряв в блоке или получив урон от взрыва. В Survival Test, съев красный гриб, игрок получает 3 урона от яда.
Когда на шкале здоровья остается 2 сердечка, она начинает мигать, предупреждая игрока о возможности скорой смерти.
В версии 1.8 была введена система голода. Теперь едой нельзя восстановить именно здоровье, но если шкала голода заполнена, единица здоровье восстанавливается за 5 секунд на всех уровнях сложности ( Кроме Peaceful ), при этом голод увеличивается. Если же шкала голода пуста, то каждые пять секунд герой будет терять по единице здоровья, пока не останется одна единица (половина сердечка).