W przeciwieństwie do nazwy, nie są to dźwięki występujące w rzeczywistych jaskiniach, jak spadające krople, a nienaturalne dźwięki. Zostały one wybrane tak, by jak najbardziej wyróżniały się spośród innych odgłosów gry i pobudzały świadomość gracza o nadchodzącym niebezpieczeństwie. Znane odgłosy jaskiń to:
odgłosy hamulców w wagonikach,
odgłosy jazdy po szynach kolejowych,
rozstrojone skrzypce (najbardziej znany dźwięk, przez graczy uznawany za najstraszniejszy),
powiewający wiatr.
Aby dźwięki te były odgrywane, w odległości 10–20 bloków od gracza musi znajdować się pomieszczenie o minimalnych wymiarach 3 × 3 × 3 i poziomie światła maks. 8. Gracz może znajdować się równie dobrze nad, jak i pod ziemią. Odgłosy te nie mają bezpośredniego związku z obecnością mobów, rud itp.
Wszystkie odgłosy jaskiń
Poniższa tabela zawiera wszystkie dotychczasowe odgłosy jaskiń znajdujące się w grze:
Nie można już zmieniać wysokości dźwięku odgłosów jaskiń. Przedtem dało się usłyszeć odgłosy cave1, cave3 oraz cave15 ze zmienioną wysokością dźwięku względem podstawowej wersji.