Chmury – obiekty, które unoszą się w powietrzu, powoli wędrując w kierunku zachodnim. Widoczne są zarówno w dzień jak i w nocy. Gracz nie może prowadzić interakcji z chmurami w jakikolwiek sposób, ponieważ nie są one blokami ani przedmiotami. Występują w grze już od jednej z wersji Classic.
Gdy w opcjach ustawienia graficzne są przełączone na ozdobne („Fancy”), chmury są trójwymiarowe. W trybie działania szybkim („Fast”) są one płaskie.
Ciekawostki
Na podstawie położenia chmur da się obliczyć współrzędną Z. Zostało to wykorzystane podczas poszukiwania ziarna generatora świata z ikony pack.png.
Chmury od wersji 1.7 są szerokie tylko na 0,1 bloku.
Gdy postać jest ponad, lub pod chmurami, to bloki, które je zasłaniają, są słabiej widoczne. Jednak, gdy jesteśmy wewnątrz chmury, wszystkie bloki, które są w jej środku są widoczne, a poza nią – nie są.
Chmury nie są widoczne, gdy patrzymy na nie przez szkło, bądź liście, i uderzamy w ten blok.
Chmury można usunąć za pomocą jakiegokolwiek programu, który obsługuje edytowanie plików PNG. Wystarczy, że usuniemy całą teksturę, która w nim jest i nadpiszemy ten plik.