V Minecraftu existují 4 základní stupně obtížnosti:
- Mírumilovná (Peaceful) – Nejsou zde žádní nepřátelé kromě Draka z Endu. Hráči se průběžně doplňují životy a nemá hlad.
- Lehká (Easy) – Hráč dostává menší zranění od nepřátel a výbuchů.
- Normální (Normal) – Normální obtížnost hry, při hladovění hráči zůstane jen půl srdce (1 bod života).
- Těžká (Hard) – Hráč dostává větší zranění od nepřátel a výbuchů, zombie mohou ničit dveře a hráč může vyhladovět k smrti.